ארון הברית מבטא את השראת השכינה בישראל. הוא עומד במרכז קדש הקדשים, על גבי אבן השתיה. יחד וסמוך לארון הונחו: לוחות הברית השבורים, הלוחות השלמים, ספר התורה שכתב משה רבנו, צלוחית שמן המשחה, צנצנת המן ומטה אהרן שפרח. ה'מכסה' של הארון נקרא הכפורת, ועליו היו שני כרובים עשויים זהב סוככים בכנפיהם על הארון. הכרובים הפונים זה אל זה מביאים לידי ביטוי את הקשר והחיבה שבין הקב"ה וכנסת ישראל.